Это полнометражное аниме, продолжающее историю знаменитого сериала о молодом человеке, который унаследовал способность видеть мир духов. Такаси Нацумэ, избавившись от одиночества благодаря друзьям-духам и загадочной тетради дружбы, наконец-то обрёл гармонию в человеческом мире. Однако его покой нарушает таинственное явление в городе — появляется призрак, чьё появление вызывает череду странных...
Сериал рассказывает историю Такаси Нацумэ — подростка, который с детства видит йокай и духи, из-за чего постоянно переезжал с места на место. После смерти бабушки он перебирается в её старый дом и находит загадочный дневник под названием «Тетрадь дружбы». В нём бабушка Реико подробно описывала свои столкновения с потусторонними существами и договоры, которые она с ними заключала.