В мире, где 80% населения обладает уникальными суперспособностями, будущие герои продолжают учиться. После событий первого фильма ученики академии Ёсихары отправляются на изолированный остров для участия в специальной программе по поддержанию порядка. Под руководством опытных профессиональных героев они отрабатывают навыки спасения в условиях, максимально приближенных к реальным.
Действие разворачивается в альтернативной версии средневековья, где человеческие поселения отчаянно сражаются за выживание против существ по имени ёма — кровожадных оборотней, способных принимать человеческий облик и поглощать мозги жертв, завладевая их памятью. Для защиты людей была создана тайная Организация, вырастившая орден воительниц-клеймор.