После того как капитан Кирк и его команда сознательно уничтожили свой корабль «Энтерпрайз», чтобы спасти жизнь Спока, они возвращаются на Землю на угнанном клингонском крейсере. Их ждёт не триумф, а суд за многочисленные проступки. Но планету одновременно поражает новая, абсолютно загадочная угроза: к Земле приближается исполинский космический объект неизвестной конструкции, который блокирует...
После триумфального, но тяжёлого поражения Хана капитану Джеймсу Керку не о чем радоваться. Его лучший друг, командующий Спок, погиб, жертвуя собой ради спасения «Энтерпрайза». Потеря кажется невосполнимой, а ситуация усугубляется, когда лучший друг Керка, доктор Мак-Кой, под воздействием странной энергии начинает терять рассудок.
В фильме «Звездный путь 2: Гнев Хана» капитану Джеймсу Кирку, ныне адмиралу, предстоит столкнуться с кризисом среднего возраста и чувством утраченной цели. Эта внутренняя борьба резко обрывается, когда на планете Сета Альфа 5 обнаруживается выживший после катастрофы Хан Нонинг — гениальный, сильный и безжалостный сверхчеловек, созданный в эugenics-программах.