Действие разворачивается в Японии 1870-х годов, в период стремительных преобразований эпохи Мэйдзи, когда страна, открывшись миру, пытается отказаться от вековых традиций. Американский капитан Нейтан Олгрен, опытный офицер, нанят императором для обучения новой армии современным методам ведения войны, чтобы подавить восстание самураев, верных старому укладу.
В жарком лете 1977 года мир потрясает сенсационная находка у подножия священной горы Фудзи: в расщелине обнаружены окаменевшие яйца динозавров, пролежавшие миллионы лет. Казалось бы, они — лишь ценнейший палеонтологический артефакт, но природа готовит жестокий сюрприз. Серия мощных природных катаклизмов становится триггером, пробуждая древних обитателей Земли от спячки.