После успешного захвата Соломона Лейна его последователи, «Апостолы», получают в своё распоряжение украденный плутоний и ставят перед собой цель спровоцировать глобальную ядерную угрозу. Итан Хант и его команда из МВФ оказываются в эпицентре этой новой опасности, где каждая ошибка может стать последней.
Пятая часть культового боевика переносит зрителей в мир, где границы между врагом и союзником стерты. После событий предыдущих фильмов Международный валютный фонд распущен, а Итан Хант оказался в изоляции, лишившись поддержки государства. Его новая угроза — Синдикат, высокотехнологичная организация бывших спецагентов из разных стран, действующих как «племя изгоев».