После очередной ссоры с семьёй молодой человек Рёхэй Арису, привыкший к уединённой жизни за игровыми консолями, встречается с двумя бывшими одноклассниками. Их случайная встреча в оживлённом Сибуе обрывается странным зрелищем — необъяснимым салютом в небе, после которого привычный город исчезает. Герои переносятся в мёртвую, безлюдную копию Токио, где их сразу же втягивают в жестокую систему.
Киото, 1864 год. Страна охвачена междоусобицами, и в этой кровавой воде плавает Химура Кэнсин — молодой самурай, чей невероятный дар владения мечом сделал его легендой под именем Баттосай, «Несравненный Убийца». Он не просто воин, он ходячая идея, олицетворение безжалостной силы, чья сабля уже не раз разрезала плоть и души врагов сёгуната.
Лето, которое изменило всё. Шестеро неразлучных друзей, называвших себя «супермиротворцами», столкнулись с непоправимой утратой — погибла их товарищ, яркая и жизнерадостная Мэйко Хонма. Вина, обрушившаяся на лидера группы Дзинту Ядоми, заставила его замкнуться в себе, превратившись в хикикомори, а остальные ребята разошлись по жизни: кто-то ушёл в престижную школу, кто-то пытается жить...