Спустя годы забвения культовые маппеты обнаруживают, что их знаменитая студия вот-вот перейдет в руки бездушного корпоративного магната. Чтобы сохранить наследие, оставшиеся в живых Кермит, Свинья Мисси Пигги, Гонzo и компания решают в последний раз собрать всю команду и устроить финальное, самое масштабное шоу в истории.
В этом весёлом и экшн-насыщенном продолжении знаменитой франшизы четыре брата-черепахи сталкиваются с новой, ещё более опасной угрозой. Злодей Шредер и его клан Футов вновь устраивают хаос в городе, но их оружием становится таинственное вещество — мутаген. Под его воздействием обычные люди превращаются в ужасающих монстров, угрожая всему Нью-Йорку.
В мрачных канализационных тоннелях Нью-Йорка обитает необычная семья: четыре разумные черепашки человеческого роста — Леонардо, Рафаэль, Микеланджело и Донателло — и их наставник, крыса Сплинтер. Их необычная судьба началась с радиационных отходов и японского искусства ниндзя, которые превратили обычных рептилий в героев.