Фильм «Ниндзя из Беверли-Хиллз» — это остроумная комедия ситуаций, построенная на контрасте. Главный герой Харпо, найденный в лесу младенцем и воспитанный кланом ниндзя, вырастает в полную противоположность образу легендарного воина: он неуклюж, добродушен и физически далёк от идеалов боевых искусств. Его попытки следовать строгим принципам клана порождают непрерывный цепь нелепых ситуаций.
Действие разворачивается в мрачном мире 2013 года, где после серии катаклизмов Лос-Анджелес откололся от материка и превратился в гигантскую открытую тюрьму для всех, кого власть считает неугодными. В этом аду правит беззаконие, а на континенте правят тоталитарные силы, стремящиеся к полному контролю.