Второй фильм о Балто переносит зрителей в мир, где линия между диким и домашним становится всё более размытой. Герой первой части, ставший легендой, теперь сталкивается с новой, не менее важной ролью — отца. Его дочь Алу, выросшая в комфорте, чувствует себя чужой среди своих щенячьих братьев и сестер.
Это история о необычном дружбе и выживании в мире, переживающем катастрофу. Яйцо игуанодонта Аладаря случайно попадает в гнездо лемуров, и он растёт среди них, пока огненный метеорит не разрушает их райский остров. Лишённый крова, стадо динозавров во главе с Аладаром отправляется в опасное путешествие через опустошённую землю в поисках легендарной «Зелёной Долины».