Когда Губка Боб внезапно остаётся без своих знаменитых квадратных штанов, он понимает, что это дело рук таинственного призрака Летучего Голландца. Не раздумывая, он вместе с лучшим другом Патриком Старом погружается в самые тёмные и неизведанные глубины Бикини Боттом, чтобы вернуть своё имущество. Их путь лежит через затонувшие корабли, мерцающие рифы и области, куда не решаются заглядывать...
