Фильм «Джун и Джон» — это история столкновения двух миров, воплощённых в образах Джона и Джун. Джон, человек порядка и дисциплины, чья жизнь подчинена чётким правилам, неожиданно для себя встречает Джун — девушку, живущую по принципу «здесь и сейчас», для которой нет незыблемых норм. Их знакомство становится не просто взрывом эмоций, а катализатором для радикальных перемен.
После неудачного первого задания в секретной организации наёмных убийц «Тени», молодой киллерше Айре приказывают залечь на дно в Джакарте. Она поселяется в одном из беднейших районов мегаполиса, где её жизнь ограничена ожиданием новых инструкций. В этой новой, чужой для неё среде, девушка неожиданно находит отклик в сердце, сближаясь с маленьким мальчиком-сиротой, который живёт по соседству.