Мать и дочь, изо всех сил пытающиеся наладить отношения, оказываются в центре необъяснимого волшебства. Элли, уставшая от контроля со стороны родительницы, и Кэтрин, желающая видеть дочь более ответственной, загадывают друг о друге самое дерзкое желание. Наутро их мир переворачивается: они обнаруживают, что их тела поменялись местами.
«Маленький зоомагазин» — это тёплый и динамичный мультсериал, который рассказывает историю необычной дружбы. Главная героиня, школьница Блайс, обнаруживает у себя редкую способность: она может понимать, что говорят животные. Это открытие меняет её жизнь, когда она знакомится с очаровательной и эксцентричной командой зверей, живущих в ближайшем зоомагагине.
Шестнадцатилетняя Скайлар живёт обычной жизнью, пока в преддверии Хэллуина не обнаруживает семейный секрет: её род на протяжении поколений был тайным обществом охотников на монстров. Обладая врождёнными способностями, она должна принять наследие и научиться управлять силой, но монстры, которых её семья долгие годы сдерживала, просыпаются и нацеливаются на новую цель — саму Скайлар.
Действие разворачивается в XXII веке, когда человечество уже освоило все планеты Солнечной системы, а космические перелёты стали повседневностью. Центром событий становится орбитальная станция «Либэ Дельта», служащая учебным центром для подготовки нового поколения пилотов. Среди её курсантов — шестнадцатилетний Кодзи Айба, прибывший вместе с подругой детства Аой и младшим братом Юки.