Фильм «G. I. Joe. Бросок кобры: Снейк Айз» — это предыстория одного из самых загадочных персонажей вселенной G.I. Joe. Мы видим, как бездомный и не имеющий прошлого боец на арене под именем Снейк Айз решает спасти наследника древнего японского клана Арасикагэ. В награду за его отвагу клан принимает его в свои ряды, открывая доступ к секретным техникам и философии пути ниндзя.
Маргарет, молодая женщина из США, приезжает в Токио, пытаясь оставить позади тяжёлые воспоминания и обрести новую жизнь. Днём она работает учителем английского, а ночью исследует подпольные клубы, бары и знаменитые отели любви, где каждый вечер может стать началом чего-то нового. В этом хаотичном и экзотическом мире она встречает Кацу — харизматичного и опасного якудза, который мгновенно...