Мальчик Лукас, не нашедший себе места в новом городе, срывает злость на муравьиных жилицах во дворе своего дома. Его ждёт суровое возмездие: с помощью волшебного зелья муравьиный волшебник Зок уменьшает его до размеров насекомого. Теперь бывший обидчик оказывается пленником собственного поступка. Его судят перед Муравьиным Советом, и мудрая Королева выносит приговор — Лукас должен прожить...
Когда беззаботное детство в Ретровилле внезапно обрывается из-за нападения инопланетян, похитивших всех родителей, местные дети сначала ликуют. Радость от полной свободы быстро сменяется тоской и беспорядком. В этой хаотичной обстановке именно Джимми Нейтрон, мальчик-гений с неуёмной фантазией и лабораторией в сарае, берёт на себя ответственность.