Фильм «Партизанка» переносит зрителя в самый разгар Второй мировой войны, в 1941 год, когда Польша находится под двойной оккупацией нацистской Германии и Советского Союза. Главная героиня, Кристина Скарбек, — опытная польская разведчица, которая по заданию британских спецслужб совершает опаснейшее путешествие через Венгрию в оккупированную Варшаву.
Действие разворачивается в атмосферных улицах и подземельях Кракова, где история переплетается с современностью. Главная героиня, одаренная и решительная, присоединяется к загадочному профессору и его небольшой, но сплоченной группе исследователей. Их миссия — выявлять и нейтрализовывать паранормальные аномалии, порождаемые древними злами, пробудившимися в городе.