1993 год. В эпоху перестройки и открывающихся границ, когда поезд К3 «Пекин — Москва» стал символом нового железнодорожного сообщения между двумя странами, на его маршруте появляется беспощадная банда грабителей. Для ликвидации этой угрозы Пекин отправляет в Москву группу своих лучших оперативников, которые должны работать под прикрытием, в условиях, где доверие — редкий и ценный товар.
Фильм «Ниндзя из Беверли-Хиллз» — это остроумная комедия ситуаций, построенная на контрасте. Главный герой Харпо, найденный в лесу младенцем и воспитанный кланом ниндзя, вырастает в полную противоположность образу легендарного воина: он неуклюж, добродушен и физически далёк от идеалов боевых искусств. Его попытки следовать строгим принципам клана порождают непрерывный цепь нелепых ситуаций.