Сериал «Черная молния» рассказывает историю Джефферсона Пирса, человека с двойной жизнью. Многие годы назад он был супергероем Чёрной Молнией, обладающим способностью управлять электричеством, и защищал город Фридмонт от преступников. Однако после трагических событий, унёсших жизнь его партнёра, он принял тяжёлое решение — навсегда отказаться от маски, чтобы посвятить себя семье и работе.
Действие разворачивается в мрачном будущем, где Земля превратилась в пустошь, отданную на откуп инопланетным тварям. Выжившие, в основном дети-сироты, живут в постоянном страхе, а их единственная надежда — огромный корабль «СкайАрк», способный унести последних представителей человечества к новой жизни. Главный герой, юный наследник погибшего лидера, берет на себя ответственность за спасение.